Sdr  Zulkarnain Awat Amir menjadi calon legislatif untuk DPD pada Pemilu 2009. Dia menjadi calon dari Daerah Pemilihan Maluku. Total suara sah pada pemilihan umum untuk DPD dari Maluku adalah . Sdr Zulkarnain Awat Amir menerima suara, Dalam daftar calon partai . Sdr Zulkarnain Awat Amir menjadi calon nomor 26 . Hasil suara ini menjadikan Sdr  Zulkarnain Awat Amir sebagai pemenang berurutan. Mengingat yang menang adalah keempat calon dengan suara paling banyak maka Sdr Zulkarnain Awat Amir menjadi pemenang kursi DPD untuk Maluku  pada Pemilu 2009.